Chiều dài lớn nhất được ghi nhận ở P. carlhubbsi là 13 cm. P. carlhubbsi có màu vàng với một dải đen mang hình dạng của lưỡi hái ở hai bên thân (bắt nguồn cho tên gọi thông thường của loài cá này). Một dải đen khác từ gốc vây lưng băng qua mắt và chéo xuống mõm. Đa số các tia gai của vây lưng và phần mềm của vây hậu môn có màu đen, trừ một vài gai vây lưng trước và các gai của vây hậu môn có màu vàng. Vây đuôi trong mờ, màu xám, được viền đen ở rìa trên và dưới. Vây bụng màu đen, trừ gai trước màu vàng.[4]

Số gai ở vây lưng: 13; Số tia vây ở vây lưng: 19–20; Số gai ở vây hậu môn: 3; Số tia vây ở vây hậu môn: 14–16; Số gai ở vây bụng: 1; Số tia vây ở vây bụng: 5.[4]

P. carlhubbsi có kiểu hình rất giống với Prognathodes falcifer, một loài ở phía bắc phạm vi của P. carlhubbsi. Cả hai có thể được phân biệt dựa vào một số đặc điểm sau:

• Vùng thân bên dưới dải đen hình lưỡi hái có màu trắng ở P. falcifer, vàng ở P. carlhubbsi.[5]
• Chóp nhọn của dải đen hình lưỡi hái ở P. carlhubbsi nằm ngay gốc các gai vây lưng ở P. carlhubbsi, nhưng chỉ nằm gần và cách một khoảng ở P. falcifer.[4]
• Sọc đen từ đỉnh đầu xuống mõm có màu đen sẫm hoàn toàn ở P. carlhubbsi, nhưng nhạt dần từ trước mắt xuống mõm ở P. falcifer.[4]